Cơ cấu tổ chức của Khoa Vật liệu Xây dựng gồm các đơn vị trực tiếp thực hiện công tác đào tạo, các bộ phận hỗ trợ và các tổ chức tư vấn – nghiên cứu có liên quan chặt chẽ. Khoa có bốn đơn vị trực tiếp thực hiện công tác đào tạo, bao gồm ba Nhóm chuyên môn phụ trách giảng dạy lý thuyết và một Nhóm chuyên môn thí nghiệm và nghiên cứu vật liệu xây dựng.

Văn phòng Khoa là bộ phận giúp việc cho Ban Chủ nhiệm Khoa, thực hiện các nhiệm vụ về quản lý hành chính, tổ chức, đào tạo và các hoạt động thường xuyên của Khoa.

Tổ Đảm bảo chất lượng Khoa Vật liệu Xây dựng được thành lập dưới sự điều hành của Phòng Khảo thí và Đảm bảo chất lượng của Trường, có chức năng hỗ trợ Ban Chủ nhiệm Khoa và phối hợp với các nhóm chuyên môn trong việc triển khai và thực hiện công tác đảm bảo chất lượng giáo dục.

Hội đồng Khoa học và Đào tạo của Khoa được thành lập nhằm tư vấn cho Trưởng Khoa trong việc xây dựng kế hoạch, định hướng phát triển, triển khai các nhiệm vụ đào tạo, nghiên cứu khoa học và hợp tác chuyên môn.

Ngoài ra, Viện Nghiên cứu và Ứng dụng Vật liệu Xây dựng là đơn vị có mối quan hệ chặt chẽ với Khoa trong các hoạt động nghiên cứu, ứng dụng khoa học – công nghệ và cung cấp dịch vụ tư vấn chuyên ngành. Hầu hết các cán bộ chủ chốt của Viện đồng thời cũng là giảng viên của Khoa, góp phần gắn kết chặt chẽ giữa đào tạo, nghiên cứu và thực tiễn sản xuất.

Cơ cấu tổ chức và hoạt động đào tạo của Khoa Vật liệu xây dựng được mô tả qua sơ đồ sau: